Tópicos a serem abordados:

Módulo 1: Fundamentos e Preparação dos Dados
Módulo 2: Controle de Qualidade (QC)
Módulo 3: Normalização e Identificação de Variáveis

Módulo 4: Redução de Dimensionalidade e Clusterização

Módulo 5: Anotação Biológica

Módulo 6: Análise de Expressão Diferencial (DEA) entre Condições

 

Metodologia: O minicurso será de natureza teórico-prática. Os conceitos fundamentais serão apresentados brevemente, seguidos imediatamente pela aplicação prática em um script de R (estilo hands-on). Será utilizado um dataset público simplificado (GEO) para garantir que todos os participantes consigam rodar as análises em seus próprios computadores durante o curso.

Tópicos a serem abordados: Fundamentos de biologia molecular aplicados à análise de ácidos nucleicos; Princípios da PCR convencional, RT-qPCR e PCR digital; Bases da amplificação, fluorescência e detecção em tempo real; Diferenças entre quantificação relativa e absoluta; Vantagens e limitações da RT-qPCR e da PCR digital; Planejamento experimental e organização de placas/reações; Sistemas de detecção por fluorescência e interpretação de curvas; Métodos de análise da RT-qPCR, incluindo Ct, ΔCt, ΔΔCt e curva padrão; Fundamentos da PCR digital, incluindo particionamento da amostra e quantificação absoluta; Interpretação de resultados de PCR digital e comparação com RT-qPCR; Controle de qualidade, padronização e principais fontes de erro; Aplicações científicas e clínicas da RT qPCR e da PCR digital; Análise de dados, testes estatísticos e confecção de gráficos.

Metodologia: O curso será ministrado em formato de aula expositiva dialogada, associada à discussão de exemplos práticos e análise orientada de resultados. A proposta inclui atividades aplicadas voltadas à interpretação de dados de RT- qPCR e PCR digital, realização de cálculos, comparação entre métodos, aplicação de testes estatísticos e elaboração de gráficos. Para participação efetiva, recomenda-se que cada aluno disponha de computador com Excel instalado, a fim de acompanhar as atividades práticas e exercícios de análise durante o minicurso.

Para realizar esse minicurso é necessário levar notebook.

Tópicos a serem abordados: Descoberta do sistema CRISPR e seu funcionamento em procariotos; desenvolvimento da tecnologia de edição gênica baseada no sistema CRISPR; fundamentos moleculares da edição gênica por CRISPR; aplicações em pesquisa e medicina; questões éticas associadas à edição gênica; planejamento de experimentos de edição gênica.

Metodologia: Aula teórica expositiva integrada a uma atividade prática introdutória, na qual os alunos irão aprender a desenhar RNAs guias e planejar experimentos de edição gênica, promovendo a aplicação dos conceitos abordados.

Para realizar esse minicurso é necessário levar notebook.

Tópicos a serem abordados: Estrutura e organização do genoma humano; mecanismos de regulação da expressão gênica; elementos regulatórios no DNA; contribuições do consórcio ENCODE; identificação de regiões potencialmente regulatórias e suas possíveis relações com doenças.​
Objetivos do curso: O minicurso será conduzido por meio de exposição teórica dos conceitos fundamentais, combinada com atividades práticas utilizando o UCSC Genome Browser em ambiente online.

Para realizar esse minicurso é necessário levar notebook.

Tópicos a serem abordados: amplificação de ácidos nucleicos por PCR, LAMP e RPA; visualização de resultados de amplificação (eletroforese em gel de agarose, repórteres fluorescentes etc.); origem e aplicações do sistema CRISPR-Dx; associação RPA/CRISPR-Dx para diagnóstico rápido, sensível e preciso.

Metodologia: aula expositiva no turno da manhã; aulas práticas em grupo a serem realizadas no laboratório de biologia molecular da Faculdade de Farmácia no turno da tarde: RPA, eletroforese em gel de agarose, reações CRISPR-Dx.

Tópicos a serem abordados: 1. Introdução à Cultura de Células: - Definição e importância da cultura de células. - História e desenvolvimento da técnica. - Tipos de células e linhagens celulares utilizadas em cultura. 2. Princípios Básicos da Cultura de Células: - Ambiente de cultura: pH, temperatura, umidade e composição do meio de cultura. - Equipamentos e materiais necessários. - Técnicas de esterilização e assepsia. 3. Cultura de Células Monocamada: - Técnicas de manutenção e passagem de células aderentes. - Controle de qualidade e avaliação da viabilidade celular. 4. Cultura de Células em Suspensão: - Técnicas de cultivo de células em suspensão. - Contagem celular e determinação da densidade celular. 5. Técnicas Especiais em Cultura de Células: - Criopreservação de células. - Diferenciação celular. - Transfecção e expressão gênica. 6. Aplicações da Cultura de Células: - Modelos de doenças in vitro. - Testes de toxicidade e eficácia de fármacos. - Engenharia de tecidos e medicina regenerativa. 

Metodologia: O curso será ministrado de forma teórica e prática, com apresentação de slides, demonstrações de técnicas laboratoriais e discussões interativas. Serão fornecidos materiais de apoio, como protocolos de cultivo de células e artigos científicos relevantes.

Tópicos a serem abordados: Configuração de credenciais em plataformas de bioinformática (KEGG, RAST, Galaxy); Download e manipulação de genomas via linha de comando; Anotação funcional e busca de genes (Prokka, BlastKOALA, RAST); Classificação taxonômica digital (FastANI, TYGS) e filogenômica (iTOL); Refinamento de genomas com MEDUSA Web Server; Análise de sintenia com DiGAlign; Geração de gráficos de pizza e Heatmaps de ANI em ambiente R.

Metodologia: O curso será ministrado de forma prática (hands-on), seguindo um fluxo de trabalho lógico: Download → Anotação → Análises → Visualização. Os participantes utilizarão servidores web para processamento de dados e o terminal/ambiente R para análise estatística e geração de figuras de alta qualidade para publicação.

Para realizar esse minicurso é necessário levar notebook.

Tópicos a serem abordados: Estudo dos genomas mitocondriais com enfoque em sua organização, composição gênica e variabilidade entre diferentes grupos de organismos; Processos de replicação e transcrição mitocondrial, importância em estudos evolutivos e clínicos; Elementos associados, como NUMTs e vírus mitocondriais; Introdução a ferramentas bioinformáticas para análise de dados de DNA mitocondrial.

Metodologia: Aula teórica expositiva e aula prática para análise de dados.

Para realizar esse minicurso é necessário levar notebook.

Tópicos a serem abordados:

• Mecanismos moleculares da tumorogenese e resistência à fármacos. 

• Identificação de biomarcadores no diagnóstico, origem, prognóstico e tratamento do câncer. 

• Utilização da biópsia líquida e suas aplicações. 

• Integração das ÔMICAS (genômica, transcriptômica e proteômica) na medicina personalizada do câncer. 

Metodologia: Aulas expositivas com base em evidências científicas atualizadas. Estudos de casos clínicos para contextualização e aplicação prática dos conceitos